L’idée d’une commission jeunesse a émergé en 1999. Cela faisait une dizaine d’années déjà que les organismes jeunesse de l’Acadie ralliaient leurs forces dans l’organisation annuelle du Festival jeunesse de l’Acadie. C’est au cours de l’été 2000 que les fondements de base de la Commission jeunesse de l’Acadie ont été initiés. Le 17 novembre de cette même année, le Conseil d’administration de la SNA crée la Commission jeunesse de l’Acadie (CJA).

Depuis sa création, la Commission jeunesse de l’Acadie a initié l’idée d’un Parlement jeunesse de l’Acadie et d’un Grand rassemblement jeunesse. Ces deux événements furent réalisés entre les 11 et 16 août 2004 à Halifax dans le cadre des célébrations du 400e anniversaire de l’Acadie et en marge du Congrès mondial acadien de la même année.

Forte de la réussite évidente du Grand rassemblement jeunesse 2004, le plus grand événement jeunesse faisant partie des célébrations du 400e anniversaire de l’Acadie, la Commission jeunesse de l’Acadie a préparé un plan d’action qui met en valeur l’épanouissement des jeunes Acadiennes et Acadiens des provinces atlantiques.